More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1950 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 410 aa  813    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3850  acetyl-CoA acetyltransferase  77.31 
 
 		 393 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  hitchhiker  0.00793734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3864  acetyl-CoA acetyltransferase  77.31 
 
 		 393 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3938  acetyl-CoA acetyltransferase  77.31 
 
 		 393 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.139367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4305  acetyl-CoA acetyltransferase  74.57 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.494714  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11355  acetyl-CoA acetyltransferase  74.56 
 
 		 389 aa  584  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000705906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2340  acetyl-CoA acetyltransferase  74.57 
 
 		 397 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1265  acetyl-CoA acetyltransferase  71.32 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0810323  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09440  acetyl-CoA acetyltransferase  68.38 
 
 		 400 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0953135  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6104  acetyl-CoA acetyltransferase  72.7 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1259  acetyl-CoA acetyltransferase  71.6 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1797  acetyl-CoA acetyltransferase  74.13 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3890  acetyl-CoA acetyltransferase  70.47 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.908967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2198  acetyl-CoA acetyltransferase  64.52 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462716  hitchhiker  0.000523969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  69.15 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.394541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1697  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  68.16 
 
 		 395 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.035668  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4111  acetyl-CoA acetyltransferase  66.25 
 
 		 396 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3610  acetyl-CoA acetyltransferase  67.08 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0357  acetyl-CoA acetyltransferase  68.5 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  67.58 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2394  acetyl-CoA acetyltransferase  65.67 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28550  acetyl-CoA acetyltransferase  68.42 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.278957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4891  acetyl-CoA acetyltransferase  68.16 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5999  acetyl-CoA acetyltransferase  63.39 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0314319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3687  acetyl-CoA acetyltransferase  63 
 
 		 394 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24017  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1044  acetyl-CoA acetyltransferase  63.5 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0241668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07600  acetyl-CoA acetyltransferase  59.7 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0672  acetyl-CoA acetyltransferase  63.32 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2699  acetyl-CoA acetyltransferase  56.19 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.135058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31290  acetyl-CoA acetyltransferase  56.82 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2986  acetyl-CoA acetyltransferase  56.9 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  56.97 
 
 		 398 aa  388  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5437  acetyl-CoA acetyltransferase  49.39 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  52.51 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  52.51 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  52.51 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  52.51 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5475  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5193  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5028  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5044  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  51.37 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  51.51 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5589  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  52.12 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5467  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00479259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5522  acetyl-CoA acetyltransferase  49.39 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5142  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5485  acetyl-CoA acetyltransferase  48.89 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000736039  hitchhiker  2.33e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  49 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0618953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  52.12 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  52.51 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0363  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 394 aa  362  8e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  51.37 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3453  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0400  acetyl-CoA acetyltransferase  47.88 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  51.76 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  48.74 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 		 393 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 393 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 393 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 393 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 393 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  52.76 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 		 393 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 		 392 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50.37 
 
 		 392 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  48.12 
 
 		 392 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 		 394 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 401 aa  346  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 		 393 aa  346  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  48.24 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  48.24 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 		 393 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  48.12 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3865  acetyl-CoA acetyltransferase  48.12 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  48.36 
 
 		 392 aa  339  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>