29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2315 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  348  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210153  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  34.48 
 
 		 990 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  32.93 
 
 		 1004 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  32.93 
 
 		 1004 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  32.93 
 
 		 1004 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  31.87 
 
 		 1059 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  34.93 
 
 		 1012 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  32.3 
 
 		 1007 aa  94.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  32.3 
 
 		 1007 aa  94.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  31.61 
 
 		 999 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  31.61 
 
 		 999 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  31.61 
 
 		 999 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  31.61 
 
 		 999 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  41.67 
 
 		 1006 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  41.67 
 
 		 1006 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  31.48 
 
 		 986 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0016  Tn5044 putative transposase  40.21 
 
 		 130 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000111219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  32.99 
 
 		 1028 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  32.72 
 
 		 1013 aa  85.1  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  30.18 
 
 		 994 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  29.94 
 
 		 993 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  29.94 
 
 		 993 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  29.63 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 995 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  28.07 
 
 		 990 aa  67.8  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  29.88 
 
 		 995 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  25.93 
 
 		 989 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3384  hypothetical protein  35.21 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3205  hypothetical protein  49.06 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>