11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3205 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3205  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486471  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  49.12 
 
 
1028 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  47.06 
 
 
990 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2315  hypothetical protein  49.06 
 
 
171 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210153  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  37.31 
 
 
993 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  37.31 
 
 
993 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  51.43 
 
 
1006 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  51.43 
 
 
1006 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  51.43 
 
 
212 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0016  Tn5044 putative transposase  38.46 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000111219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  47.22 
 
 
997 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>