75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0225 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0225  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like  100 
 
 
435 aa  868    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.282782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6655  putative glycosyl transferase  76.33 
 
 
390 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.687261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6670  putative glycosyl transferase  56.94 
 
 
362 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.252387  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0649  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  33.43 
 
 
618 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0830  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
593 aa  103  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.297317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1913  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.07 
 
 
390 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1910  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  30.1 
 
 
377 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4986  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.79 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1550  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like protein  30.72 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1256  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.75 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3178  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  30.52 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0034  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.62 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2414  monogalactosyldiacylglycerol synthase  26.85 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.798325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1210  monogalactosyldiacylglycerol synthase  31.52 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1764  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.65 
 
 
369 aa  77  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1794  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.94 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0550  monogalactosyldiacylglycerol synthase  30.2 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0514  diacylglycerol glucosyltransferase  22.73 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2476  monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.82 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460024  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2527  monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.22 
 
 
482 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4809  diacylglycerol glucosyltransferase  22.47 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.912854  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4132  monogalactosyldiacylglycerol synthase  30.37 
 
 
396 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.950432  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2058  monogalactosyldiacylglycerol synthase  31.06 
 
 
373 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0433  diacylglycerol glucosyltransferase  22.64 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0428  diacylglycerol glucosyltransferase  22.44 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0710  putative monogalactosyldiacylglycerol synthase  21.64 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0565  diacylglycerol glucosyltransferase  21.88 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0567  diacylglycerol glucosyltransferase  22.32 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1551  hypothetical protein  28.8 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.169647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0647  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like protein  31.52 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0422  diacylglycerol glucosyltransferase  21.35 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.630174  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1184  monogalactosyldiacylglycerol synthase  26.98 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540237  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0492  diacylglycerol glucosyltransferase  21.35 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0511  diacylglycerol glucosyltransferase  21.35 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0426  diacylglycerol glucosyltransferase  21.35 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.75702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0483  diacylglycerol glucosyltransferase  21.35 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0629  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like protein  32.07 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.768955  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4177  glycosyltransferase family 28 protein  35.9 
 
 
886 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359054  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119506  Monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) synthase  30.34 
 
 
501 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0646  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  25.99 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5556  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like  35.53 
 
 
875 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0393  UDP-glucuronosyltransferase  20.62 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1966  monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.66 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1711  monogalactosyldiacylglycerol synthase  21.09 
 
 
382 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4379  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  25.12 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000132765  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9619  predicted protein  27.07 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2994  monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.96 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000104311  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2020  monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.84 
 
 
432 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0325  Glycosyltransferase 28 domain protein  23.89 
 
 
911 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0606  diacylglycerol glucosyltransferase  19.88 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.274729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2159  glycosyltransferase 28 domain-containing protein  27.04 
 
 
365 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2070  Glycosyltransferase 28 domain protein  23.71 
 
 
911 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3363  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.78 
 
 
379 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.879396  hitchhiker  0.000552122 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09980  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase  24.19 
 
 
561 aa  53.1  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000101238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1241  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.23 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0913684  normal  0.975146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1892  monogalactosyldiacylglycerol synthase  19.38 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2095  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  34.38 
 
 
367 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.310142  hitchhiker  0.00000372549 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1203  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  25 
 
 
363 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43938  predicted protein  22.06 
 
 
559 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2470  putative monogalactosyldiacylglycerol synthase  23.96 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  30.84 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08850  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  31.39 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.546527  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3364  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  30.98 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.804764  hitchhiker  0.000516086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3601  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.5 
 
 
357 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0278  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase  30.32 
 
 
394 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2180  putative monogalactosyldiacylglycerol synthase  23.44 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351092  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4013  hypothetical protein  24.12 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1262  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  30.25 
 
 
353 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1810  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  23.93 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.674184  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14125  monogalactosyldiacylglycerol synthase  26.34 
 
 
394 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4157  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.68 
 
 
351 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.780678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4117  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.68 
 
 
351 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0213  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.47 
 
 
355 aa  43.1  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0659  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  30.23 
 
 
374 aa  43.1  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2312  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.71 
 
 
357 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506924  normal  0.77873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>