26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2001 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  100 
 
 
85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  48 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  45.33 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  47.95 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  48.68 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  45.95 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  46.67 
 
 
88 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  42.67 
 
 
75 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  47.37 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  44.74 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  50 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  41.56 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  44.16 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  42.11 
 
 
89 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  64.29 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  47.06 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  38.27 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  40.26 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  42.86 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  37.66 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  40.26 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  35.59 
 
 
69 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  27.27 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  36.84 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>