25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0580 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  70.27 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  69.44 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  69.44 
 
 		 79 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  68.06 
 
 		 75 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  64.86 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  65.28 
 
 		 75 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  62.67 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  63.89 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  63.77 
 
 		 75 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  62.67 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  55.41 
 
 		 84 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  71.62 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  61.33 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  57.33 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  57.33 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  51.43 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  51.43 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  48.61 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  45.95 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  41.67 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  35.21 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  47.62 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>