24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2747 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  91.01 
 
 
89 aa  163  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  87.64 
 
 
89 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  83.54 
 
 
86 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  70.51 
 
 
77 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  64.1 
 
 
78 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  63.64 
 
 
87 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  58.67 
 
 
75 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  57.89 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  62.67 
 
 
74 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  55 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  52.05 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  55.26 
 
 
75 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  64.94 
 
 
81 aa  89.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  49.28 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  45.45 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  44.16 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  41.67 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  30.26 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  38.1 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>