24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0411 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  100 
 
 
77 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  77.92 
 
 
78 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  75 
 
 
87 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  70.51 
 
 
86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  70.51 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  69.23 
 
 
89 aa  110  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  69.44 
 
 
74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  67.95 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  71.05 
 
 
81 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  68.06 
 
 
75 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  63.89 
 
 
79 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  58.9 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  61.11 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  57.53 
 
 
75 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  48.05 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  51.43 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  53.62 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  51.32 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  45.83 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  47.37 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  40.28 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  37.18 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  34.92 
 
 
94 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  47.37 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>