30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0446 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  54.29 
 
 		 75 aa  89.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  49.32 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  54.17 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  48.05 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  52.11 
 
 		 79 aa  84.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  47.3 
 
 		 75 aa  83.6  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  51.43 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  52.78 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  52.7 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  52.78 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  47.56 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  46.67 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  45.95 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  45.45 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  56 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  43.04 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  42.86 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  44.93 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  32.95 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  36.99 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  40.91 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  32.99 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  34.02 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  29.63 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  29.63 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  30 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  30.26 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>