23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1495 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  69.62 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  62.32 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  55.56 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  51.43 
 
 		 74 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  51.35 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  49.28 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  47.3 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  47.3 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  48.65 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  45.83 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  47.62 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  43.04 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  50 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  47.76 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  46.75 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  37.18 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  36.76 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  50 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>