22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1779 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  100 
 
 		 82 aa  173  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  69.62 
 
 		 80 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  53.62 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  43.66 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  47.22 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  47.3 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  41.89 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  45.95 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  45.95 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  40.28 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  38.89 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  38.27 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  41.67 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  43.06 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  38.96 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  40.28 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  30.12 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  39.44 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>