24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2830 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  100 
 
 		 79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  82.19 
 
 		 75 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  84.93 
 
 		 75 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  69.44 
 
 		 74 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  64.38 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  60.26 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  63.89 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  55.7 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  55 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  55 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  55 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  55.56 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  52.05 
 
 		 75 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  50.68 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  55.22 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  52.11 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  52.05 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  64.79 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  45.33 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  48.61 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  47.22 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  29.17 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  34.78 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  42.5 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>