23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1133 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  48.1 
 
 
87 aa  93.2  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  43.59 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  36.84 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  37.18 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  32.05 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  35.06 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  37.5 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  34.67 
 
 
81 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  35.06 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  32.88 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  28.92 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  36.92 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  29.49 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  36.99 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  37.33 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  38.36 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  52.5 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  30.38 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  36.62 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  32.86 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  30.43 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  34.15 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>