14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0291 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  59.77 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  63.75 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  63.75 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2484  hypothetical protein  60 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  48.84 
 
 		 104 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  45.98 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  48.75 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2410  hypothetical protein  39.47 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  28.57 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  30.14 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  33.33 
 
 		 87 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>