16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2484 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2484  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  87.06 
 
 
85 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  80 
 
 
85 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  75.61 
 
 
89 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  72.94 
 
 
91 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  60.26 
 
 
90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  57.5 
 
 
104 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  56.25 
 
 
104 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  50.62 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2410  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0720  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0728  hypothetical protein  32.14 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.185655  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2173  hypothetical protein  34.12 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3732  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1517  hypothetical protein  40.48 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>