15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2182 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  213  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  98.08 
 
 
104 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  74.16 
 
 
90 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  57.83 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  56.98 
 
 
91 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2484  hypothetical protein  57.5 
 
 
85 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  51.69 
 
 
89 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  51.81 
 
 
85 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  48.84 
 
 
90 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  46.25 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2173  hypothetical protein  36.67 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0720  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1517  hypothetical protein  31.52 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  34.02 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>