13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2410 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2410  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0728  hypothetical protein  44.05 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.185655  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5630  hypothetical protein  45.24 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.37891 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  36.14 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  38.27 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  38.75 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  39.47 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  34.44 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  33.77 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  32 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>