21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1395 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2484  hypothetical protein  75.61 
 
 		 85 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  71.08 
 
 		 85 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  70.24 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  66.29 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  62.5 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  54.02 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  51.69 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  50.56 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0720  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1517  hypothetical protein  31.52 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2173  hypothetical protein  34.88 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  30.67 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0728  hypothetical protein  30.86 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.185655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2410  hypothetical protein  33.77 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  30.67 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  30.99 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  34.72 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  27.27 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>