16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3296 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  66.29 
 
 
89 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2484  hypothetical protein  72.94 
 
 
85 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  68.75 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  59.77 
 
 
90 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  67.5 
 
 
85 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  56.98 
 
 
104 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  55.81 
 
 
104 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  51.14 
 
 
90 aa  98.6  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  51.25 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2410  hypothetical protein  38.27 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2173  hypothetical protein  37.65 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0720  hypothetical protein  38.81 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1517  hypothetical protein  32.18 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0728  hypothetical protein  31.33 
 
 
89 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.185655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  28.21 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>