13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1478 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1478  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  167  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0178111  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2484  hypothetical protein  50.62 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4128  hypothetical protein  48.78 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  51.25 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  48.75 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  46.99 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1051  hypothetical protein  47.5 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2182  hypothetical protein  46.25 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0915  hypothetical protein  46.84 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2410  hypothetical protein  36.14 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0720  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  36.84 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>