194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1376 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  57.25 
 
 
261 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  56.42 
 
 
288 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  54.47 
 
 
266 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  55.25 
 
 
265 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  46.46 
 
 
285 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  45.49 
 
 
268 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  44.49 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  43.41 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  45.1 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  43.3 
 
 
272 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  44.96 
 
 
270 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  46.78 
 
 
262 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  46.85 
 
 
267 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  44.27 
 
 
258 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  45.04 
 
 
256 aa  204  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  45.04 
 
 
256 aa  204  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  45.14 
 
 
275 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  41.96 
 
 
272 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  43.58 
 
 
270 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  44.06 
 
 
258 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  43.53 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  44.31 
 
 
272 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  43.51 
 
 
270 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  42.48 
 
 
282 aa  198  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  42.58 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  42.62 
 
 
273 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  43.48 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  42.42 
 
 
270 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  40.98 
 
 
282 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  40.16 
 
 
278 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  40.98 
 
 
289 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  41.6 
 
 
272 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  43.45 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  43.37 
 
 
272 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  45.49 
 
 
262 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  44.16 
 
 
263 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  43.7 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  39.17 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  41.87 
 
 
272 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  41.77 
 
 
263 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  43.1 
 
 
246 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  40.15 
 
 
287 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  42.34 
 
 
275 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  43.88 
 
 
260 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  41.67 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  40.88 
 
 
289 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  40.08 
 
 
275 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  37.4 
 
 
275 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  39.83 
 
 
277 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  37.34 
 
 
267 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  36.6 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  37.34 
 
 
267 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  35.42 
 
 
270 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  33.73 
 
 
267 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  33.73 
 
 
267 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  35.29 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  37.33 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  33.91 
 
 
273 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  34.1 
 
 
265 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  36.11 
 
 
280 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  32.34 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  35.05 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  30.51 
 
 
301 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  37.22 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  29.44 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  29.63 
 
 
264 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  28.95 
 
 
262 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  30.23 
 
 
262 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  31.75 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  28.17 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  31.6 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  32.81 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  29.87 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  29.22 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  26.36 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  30.51 
 
 
237 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  30 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  29.39 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  32.48 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0614  Creatininase  30.04 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  26.78 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  29.2 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  32.47 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2403  Creatininase  29.69 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  30.11 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  33.04 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2624  Creatininase  31.72 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  32.77 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  26.78 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  28.22 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  27.2 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1449  Creatininase  29.26 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1961  creatininase  29.57 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  32.6 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3275  creatininase  29.63 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  30.86 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4704  Creatininase  30.04 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1019  creatininase  29.41 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  24.89 
 
 
226 aa  77  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>