197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3547 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  100 
 
 
266 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  83.71 
 
 
265 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  84.03 
 
 
288 aa  470  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  54.47 
 
 
265 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  48.25 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  47.24 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  46.59 
 
 
270 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  48.24 
 
 
262 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  47.57 
 
 
275 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  48.03 
 
 
261 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  48.05 
 
 
271 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  47.04 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  48.06 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  45.06 
 
 
285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  42.75 
 
 
268 aa  231  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  46.64 
 
 
258 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  43.97 
 
 
266 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  45.08 
 
 
270 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  43.68 
 
 
272 aa  225  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  43.75 
 
 
272 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  44.02 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  46.5 
 
 
256 aa  221  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  46.5 
 
 
256 aa  221  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  42.86 
 
 
272 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  44.4 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  41.89 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  44.4 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  40.3 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  42.8 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  40.68 
 
 
270 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  43.5 
 
 
262 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  46.25 
 
 
258 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  40.15 
 
 
278 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  41.35 
 
 
282 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  41.63 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  41.57 
 
 
282 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  46.84 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  41.54 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  41.85 
 
 
286 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  42.53 
 
 
287 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  43.04 
 
 
262 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  41.47 
 
 
263 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  42.53 
 
 
275 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  40.17 
 
 
247 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  41.7 
 
 
275 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  39.45 
 
 
263 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  38.91 
 
 
267 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  40.93 
 
 
289 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  41.67 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  37.5 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  37.07 
 
 
275 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  35.83 
 
 
267 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  34.27 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  34.02 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  32.44 
 
 
267 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  35.89 
 
 
265 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  32.44 
 
 
267 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  36.36 
 
 
301 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  31.25 
 
 
270 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  35.89 
 
 
265 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  36.44 
 
 
287 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  34.62 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  34.31 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  33.63 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  34.73 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  29.57 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  32.5 
 
 
264 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  31.54 
 
 
262 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  32.72 
 
 
262 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  34.14 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  30.8 
 
 
263 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0614  Creatininase  30.33 
 
 
264 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  30.62 
 
 
260 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  32.5 
 
 
242 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  30.96 
 
 
267 aa  99  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  31.49 
 
 
243 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  32.91 
 
 
237 aa  98.6  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  31.47 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  29.48 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  30.52 
 
 
245 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1961  creatininase  32.31 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  31.34 
 
 
244 aa  95.5  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  33.61 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  31.21 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  29.69 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  31.17 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  28.29 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3729  creatininase  30.53 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0439  Creatininase  30.83 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  29.32 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  28.57 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3204  creatininase  33.9 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  28.11 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4704  Creatininase  33.18 
 
 
245 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  30.97 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1389  Creatininase  29.41 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1602  creatininase  30.04 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  0.080982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  32.75 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  26.48 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0793  Creatininase  29.88 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>