200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0424 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0424  creatininase  100 
 
 
272 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  87.08 
 
 
272 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  71.27 
 
 
270 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  69.52 
 
 
270 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  67.66 
 
 
270 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  67.03 
 
 
275 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  66.67 
 
 
271 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  59.4 
 
 
267 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  54.12 
 
 
258 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  53.94 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  57.26 
 
 
258 aa  265  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  50 
 
 
268 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  59.4 
 
 
267 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  52.94 
 
 
258 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  49.6 
 
 
285 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  52.67 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  47.37 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  47.37 
 
 
256 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  46.75 
 
 
273 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  44.32 
 
 
262 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  43.97 
 
 
265 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  43.75 
 
 
266 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  44.36 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  48.95 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  48.51 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  47.92 
 
 
260 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  40.3 
 
 
273 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  44.19 
 
 
282 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  44.87 
 
 
272 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  44.62 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  43.45 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  40.74 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  40.43 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  43.5 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  43.59 
 
 
272 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  39.78 
 
 
278 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  43.59 
 
 
272 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  45.91 
 
 
282 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  43.36 
 
 
286 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  44.02 
 
 
273 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  41.5 
 
 
277 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  43.32 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  43.37 
 
 
265 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  40.49 
 
 
261 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  43.51 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  41.8 
 
 
275 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  41.8 
 
 
289 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  40.76 
 
 
263 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  44.09 
 
 
282 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  41.1 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  38.49 
 
 
267 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  36.73 
 
 
270 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  37.82 
 
 
262 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  35.71 
 
 
267 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  33.9 
 
 
267 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  33.9 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  35.34 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  34.91 
 
 
265 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  36.86 
 
 
301 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  38.63 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  35.37 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  34.18 
 
 
271 aa  132  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  38.3 
 
 
284 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  31.78 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  36.17 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  31.78 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  31.78 
 
 
262 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  32.71 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  34.03 
 
 
260 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  32.08 
 
 
245 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  31.91 
 
 
242 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  31.49 
 
 
237 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  34.18 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  34.23 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  30.95 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  30.45 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  31.11 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  31.71 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  34.76 
 
 
237 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  31.95 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2403  Creatininase  28.63 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4704  Creatininase  34.4 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  32.68 
 
 
232 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  32 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2211  Creatininase  36.26 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0649  Creatininase  29.39 
 
 
233 aa  89  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  25.7 
 
 
244 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  31.06 
 
 
245 aa  89  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2624  Creatininase  32.89 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  31.74 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  30.38 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0614  Creatininase  28.57 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  35.71 
 
 
237 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0439  Creatininase  30.8 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1389  Creatininase  30.7 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569079  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  29.66 
 
 
242 aa  85.9  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  24.58 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  30.04 
 
 
226 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0080  Creatininase  30.25 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  30.17 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>