201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5132 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  100 
 
 
273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  78.31 
 
 
272 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  60.98 
 
 
266 aa  341  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  48.92 
 
 
282 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  49.81 
 
 
289 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  50.74 
 
 
282 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  50.53 
 
 
286 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  48.64 
 
 
288 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  48.25 
 
 
266 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  46.69 
 
 
265 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  53.01 
 
 
275 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  51.29 
 
 
282 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  46.33 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  45.32 
 
 
268 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  45.49 
 
 
270 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  46.42 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  46.04 
 
 
270 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  45.25 
 
 
271 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  45.95 
 
 
262 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  47.89 
 
 
275 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  42.59 
 
 
278 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  46.48 
 
 
258 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  46.09 
 
 
258 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  47.51 
 
 
289 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  45.14 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  44.49 
 
 
275 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  44.49 
 
 
265 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  46.38 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  44.53 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  44.14 
 
 
285 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  47.66 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  41.57 
 
 
272 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  43.02 
 
 
272 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  45.32 
 
 
267 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  40.3 
 
 
272 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  41.87 
 
 
272 aa  205  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  43.08 
 
 
263 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  41.57 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  43.09 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  43.75 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  41.22 
 
 
261 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  42.11 
 
 
262 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  39.38 
 
 
267 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  39.1 
 
 
275 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  40.7 
 
 
277 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  40.48 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  39.92 
 
 
262 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  38.28 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  40.08 
 
 
263 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  44.17 
 
 
260 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  37.5 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  37.35 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  39.46 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  36.25 
 
 
247 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  37.5 
 
 
267 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  41.49 
 
 
262 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  39.42 
 
 
246 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  34.76 
 
 
265 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  34.76 
 
 
265 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  38.31 
 
 
287 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  36.64 
 
 
284 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  34.67 
 
 
280 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  36.32 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  30.11 
 
 
264 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  32.05 
 
 
301 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  30.15 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  29.1 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  31.58 
 
 
262 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  33.6 
 
 
243 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  32.76 
 
 
260 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  35.68 
 
 
259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  35.34 
 
 
260 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  31.25 
 
 
242 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  29.91 
 
 
242 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10709  hypothetical protein  33.72 
 
 
251 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  33.61 
 
 
252 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  32.1 
 
 
266 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1961  creatininase  33.33 
 
 
238 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1784  creatininase  32.55 
 
 
241 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1799  creatininase  37.97 
 
 
255 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  31.2 
 
 
267 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  27.91 
 
 
245 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  33.46 
 
 
299 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  35.51 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0793  Creatininase  32.22 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0078  creatininase  38.38 
 
 
252 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  29.91 
 
 
245 aa  99.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  31.97 
 
 
240 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  36.32 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2403  Creatininase  32.03 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2624  Creatininase  32.49 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  26.8 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1659  creatininase  30.43 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142851  normal  0.859758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5108  Creatininase  35.71 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1722  creatinine amidohydrolase  29.73 
 
 
239 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.654725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1847  Creatininase  31.2 
 
 
241 aa  92.8  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1602  creatininase  32.13 
 
 
247 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  0.080982 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  27.27 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  27.78 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  28.16 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>