199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4757 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  53.05 
 
 
262 aa  305  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  50.57 
 
 
267 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  50.19 
 
 
270 aa  291  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  49.81 
 
 
267 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  50.76 
 
 
267 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  53.31 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  45 
 
 
270 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  41.22 
 
 
272 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  40.85 
 
 
272 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  41.31 
 
 
270 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  37.88 
 
 
273 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  39.11 
 
 
266 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  34.36 
 
 
264 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  38.31 
 
 
273 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  40.46 
 
 
282 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  43.28 
 
 
282 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  40.43 
 
 
273 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  34.38 
 
 
264 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  41.84 
 
 
275 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  33.2 
 
 
262 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  39.59 
 
 
267 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  35.08 
 
 
278 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  37.74 
 
 
289 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  38.87 
 
 
282 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  34.63 
 
 
265 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  33.6 
 
 
265 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  36.44 
 
 
266 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  38.13 
 
 
268 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  40.31 
 
 
270 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  41.23 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  40.54 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  37.4 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  39.33 
 
 
289 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  33.6 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  39.45 
 
 
258 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  39.62 
 
 
258 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  39.45 
 
 
267 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  39.15 
 
 
262 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  40.34 
 
 
287 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  38.08 
 
 
263 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  34.78 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  32.69 
 
 
301 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  34.75 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  35.29 
 
 
288 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  36.73 
 
 
261 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  34.2 
 
 
284 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  37.33 
 
 
265 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  37.36 
 
 
286 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  40.62 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  38.43 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  36.17 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  34.11 
 
 
285 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  36.4 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  43.98 
 
 
275 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  37.01 
 
 
266 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  38.43 
 
 
271 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  35 
 
 
256 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  35.29 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  33.84 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  36.91 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  35.91 
 
 
275 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  35.18 
 
 
273 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  37.61 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  34.47 
 
 
243 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  33.33 
 
 
263 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  31.92 
 
 
260 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  38.05 
 
 
260 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  33.33 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  33.33 
 
 
243 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  37.39 
 
 
243 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  35.16 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  36.14 
 
 
232 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  33.62 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  32.44 
 
 
247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3084  Creatininase  33.48 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1799  creatininase  34.17 
 
 
255 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  32.24 
 
 
242 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3204  creatininase  37.45 
 
 
270 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0649  Creatininase  31.43 
 
 
233 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  33.74 
 
 
262 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  34.31 
 
 
240 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10709  hypothetical protein  34.93 
 
 
251 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693631 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  29.24 
 
 
244 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1449  Creatininase  31.2 
 
 
234 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  28.02 
 
 
267 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  36.53 
 
 
259 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  31.98 
 
 
245 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0078  creatininase  32.38 
 
 
252 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  31.36 
 
 
237 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3729  creatininase  29.06 
 
 
250 aa  99  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  31.2 
 
 
252 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0793  Creatininase  33.33 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5058  creatininase  34.08 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  32.91 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3275  creatininase  32.35 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  29.91 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  31.73 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  28.88 
 
 
226 aa  96.3  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0872  creatininase  32.35 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>