187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3794 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  72.41 
 
 
262 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  72.97 
 
 
263 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  72.8 
 
 
262 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  67.49 
 
 
256 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  67.49 
 
 
256 aa  339  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  67.45 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  57.98 
 
 
247 aa  289  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  60.16 
 
 
246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  45.88 
 
 
272 aa  234  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  46.75 
 
 
272 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  43.23 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  45.78 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  44.53 
 
 
270 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  43.75 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  44.36 
 
 
270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  48.36 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  40.84 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  47.33 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  40.3 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  42.08 
 
 
265 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  42.29 
 
 
285 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  42.91 
 
 
271 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  47.03 
 
 
258 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  43.15 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  46.61 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  42.62 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  47.88 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  45.08 
 
 
267 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  43.4 
 
 
261 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  44.86 
 
 
272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  40.82 
 
 
272 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  40.78 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  40.48 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  41.46 
 
 
278 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  39.61 
 
 
272 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  39.84 
 
 
282 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  40.64 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  40.82 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  39.67 
 
 
263 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  37.82 
 
 
270 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  40.4 
 
 
286 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  39.6 
 
 
282 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  40.36 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  38.46 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  40.34 
 
 
287 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  38.46 
 
 
289 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  37.27 
 
 
275 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  34.77 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  36.14 
 
 
267 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  33.86 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  32.95 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  33.2 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  32.68 
 
 
267 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  35.18 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  31.78 
 
 
267 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  31.78 
 
 
267 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  32.95 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  31.49 
 
 
273 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  31.7 
 
 
284 aa  112  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  34.39 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  29.36 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  30.09 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  31.36 
 
 
301 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  29.24 
 
 
264 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  29.24 
 
 
264 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  34.98 
 
 
242 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  34.98 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  30.09 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  27.54 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  28.46 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  36.36 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0649  Creatininase  28.57 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0614  Creatininase  31.78 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  31.3 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  30.08 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  31.33 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1961  creatininase  29.78 
 
 
238 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  30.58 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  29.88 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1978  Creatininase  29.87 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  32.08 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  27.71 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3204  creatininase  31.97 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0872  creatininase  32.61 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  32.58 
 
 
226 aa  79  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  32.46 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  30.34 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  28.81 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  31 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0866  creatininase  32.17 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0883  creatininase  32.17 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693301  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  29.82 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0078  creatininase  30.93 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1799  creatininase  30.97 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2794  Creatininase  33.94 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  33.75 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3729  creatininase  27.9 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  30.08 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  25.4 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>