197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0569 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0569  creatininase  100 
 
 
271 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  72.93 
 
 
270 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  72.66 
 
 
270 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  68.03 
 
 
275 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  67.16 
 
 
270 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  66.67 
 
 
272 aa  359  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  69.14 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  60.08 
 
 
267 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  58.5 
 
 
262 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  56.42 
 
 
258 aa  278  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  56.03 
 
 
258 aa  276  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  50.95 
 
 
268 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  58.37 
 
 
267 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  56.03 
 
 
258 aa  258  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  51.56 
 
 
285 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  46.62 
 
 
272 aa  234  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  48.05 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  45.25 
 
 
273 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  46.09 
 
 
265 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  46.88 
 
 
288 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  46.01 
 
 
272 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  45.45 
 
 
262 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  47.5 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  47.5 
 
 
256 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  42.97 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  45.25 
 
 
282 aa  214  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  42.91 
 
 
273 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  45.45 
 
 
263 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  47.7 
 
 
246 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  46.88 
 
 
262 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  43.08 
 
 
289 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  45.04 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  48.12 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  43.48 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  41.7 
 
 
270 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  41.92 
 
 
272 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  43.21 
 
 
286 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  47.69 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  42.86 
 
 
287 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  39.52 
 
 
278 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  41.54 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  41.11 
 
 
289 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  41.47 
 
 
277 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  42.64 
 
 
275 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  37.97 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  42.02 
 
 
275 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  40.23 
 
 
272 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  41.44 
 
 
261 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  40.71 
 
 
263 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  41.74 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  39.37 
 
 
267 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  35.91 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  40.52 
 
 
280 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  37.77 
 
 
265 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  33.33 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  36.91 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  33.33 
 
 
262 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  32.06 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  33.72 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  36.8 
 
 
273 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  36.29 
 
 
301 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  39.66 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  31.4 
 
 
267 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  33.47 
 
 
264 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  31.4 
 
 
267 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  33.76 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  34.5 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  38.43 
 
 
287 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  35.1 
 
 
299 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  33.19 
 
 
242 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  30.86 
 
 
260 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  33.78 
 
 
260 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  30.4 
 
 
260 aa  102  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  31.98 
 
 
237 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  29.5 
 
 
245 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  30.92 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  30.08 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  29 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  34.78 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4704  Creatininase  32.48 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  34.66 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  34.02 
 
 
232 aa  92.4  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  29.25 
 
 
242 aa  92  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2624  Creatininase  34.48 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0649  Creatininase  28.96 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  33.6 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2211  Creatininase  35.18 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0872  creatininase  32.4 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1449  Creatininase  27.38 
 
 
234 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0080  Creatininase  30.89 
 
 
249 aa  89  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  33.33 
 
 
266 aa  89  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1389  Creatininase  28.74 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569079  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0439  Creatininase  29.72 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  32.19 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  31.22 
 
 
243 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0205  Creatininase  29.2 
 
 
253 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2052  Creatininase  27.03 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  34.27 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0866  creatininase  32 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0883  creatininase  32 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>