201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0472 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  100 
 
 
270 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  80 
 
 
270 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  80.6 
 
 
270 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  71.27 
 
 
272 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  71.27 
 
 
272 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  67.16 
 
 
271 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  65.56 
 
 
275 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  60.47 
 
 
267 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  58.53 
 
 
258 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  59.84 
 
 
262 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  58.14 
 
 
258 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  60 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  51.7 
 
 
268 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  54.94 
 
 
285 aa  271  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  57.36 
 
 
258 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  46.72 
 
 
265 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  46.32 
 
 
288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  49.81 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  46.59 
 
 
266 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  45.49 
 
 
273 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  44.49 
 
 
266 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  45.86 
 
 
272 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  45.68 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  45.68 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  44.53 
 
 
273 aa  218  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  48.55 
 
 
282 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  45.49 
 
 
262 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  42.75 
 
 
278 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  45.11 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  45.14 
 
 
272 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  45.91 
 
 
277 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  43.85 
 
 
289 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  43.8 
 
 
270 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  46.94 
 
 
260 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  47.27 
 
 
275 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  46.18 
 
 
263 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  46.44 
 
 
272 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  43.58 
 
 
265 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  43.48 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  45.68 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  45.53 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  48.17 
 
 
261 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  45.8 
 
 
275 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  46.39 
 
 
289 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  40.25 
 
 
247 aa  193  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  43.82 
 
 
287 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  46.22 
 
 
262 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  46.28 
 
 
282 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  47.03 
 
 
275 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  43.08 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  42.58 
 
 
263 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  35.98 
 
 
267 aa  168  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  38.22 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  36.43 
 
 
270 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  34.88 
 
 
267 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  34.88 
 
 
267 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  37.75 
 
 
265 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  37.35 
 
 
265 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  41.31 
 
 
287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  40.59 
 
 
273 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  38.82 
 
 
280 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  37.71 
 
 
301 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  41.49 
 
 
284 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  36.8 
 
 
271 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  32.56 
 
 
264 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  32.68 
 
 
264 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  33.33 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  32.56 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  34.1 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  35.6 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  38.63 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  31.49 
 
 
242 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  36.6 
 
 
240 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  33.33 
 
 
259 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  36.96 
 
 
237 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  33.76 
 
 
245 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0649  Creatininase  32.82 
 
 
233 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  35.66 
 
 
252 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  32.27 
 
 
237 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  29.7 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  32.05 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  30.93 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  31.05 
 
 
226 aa  97.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  27.39 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  35.68 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  30.4 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1389  Creatininase  30.45 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569079  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0751  creatininase  29.39 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.67672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2211  Creatininase  39.41 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  32.24 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  30.99 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  30 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  33.18 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  30.31 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10709  hypothetical protein  35.87 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3204  creatininase  34.66 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  28.51 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2052  Creatininase  26.11 
 
 
252 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  26.29 
 
 
243 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0205  Creatininase  31.58 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>