199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2766 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2766  creatininase  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  72.97 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  69.85 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  71.76 
 
 		 262 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  63.67 
 
 		 256 aa  328  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  63.67 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  64.49 
 
 		 260 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  52.7 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  60.17 
 
 		 246 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  49.38 
 
 		 272 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  48.95 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  44.61 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  46.88 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  44.31 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  46.18 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  45.31 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  45.45 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  45.35 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  47.04 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  45.35 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  41.54 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  40.08 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  44.96 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  44.96 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  39.06 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  39.45 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  44.16 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  42.68 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  45.04 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  40.08 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  44.57 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  39.84 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  40.23 
 
 		 282 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  42.06 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  39.15 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  42.98 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  41.18 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  42.68 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  36.86 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  37.11 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  38.49 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  38.46 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  36.89 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  36.05 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  38.1 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  39.82 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  37.2 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  39.67 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  36.86 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  35.98 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  35.66 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  32.17 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  31.65 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  31.65 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  31.95 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  31.4 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  33.33 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  32.53 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  32.03 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  30.13 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  30.13 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  30.43 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  33.33 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  32.2 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  31.5 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  30.56 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  27.94 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  27.16 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  31.36 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  35.26 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  28.51 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3150  creatininase  33.2 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0614  Creatininase  29.15 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  29.22 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3729  creatininase  30.17 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1449  Creatininase  29.83 
 
 		 234 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  30.21 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  30.2 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  31.3 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  35.22 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1961  creatininase  29.61 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  31.92 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  27.91 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  26.32 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3204  creatininase  29.84 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  31.78 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1978  Creatininase  29.91 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  26.72 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  31.14 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  27.23 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3275  creatininase  33.33 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  26.89 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2403  Creatininase  26.64 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  26.14 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  29.18 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1406  creatininase  29.82 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.708048  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1019  creatininase  28.57 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  29.3 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  32.6 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  23.24 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>