199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3053 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  42.75 
 
 
266 aa  215  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5132  Creatininase  43.08 
 
 
273 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3147  creatininase  42.8 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0394  creatininase  43.58 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  42.69 
 
 
288 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3746  creatininase  44.44 
 
 
286 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  41.47 
 
 
266 aa  188  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1680  Creatininase  39.85 
 
 
265 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195297  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4255  creatininase  41.54 
 
 
282 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7483  hypothetical protein  41.2 
 
 
275 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.039652  normal  0.0970376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  42.08 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1083  creatininase  46.3 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115245  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0928  putative creatinine amidohydrolase  41.37 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0986  creatinine amidohydrolase, putative  41.37 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  41.54 
 
 
272 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  41.06 
 
 
278 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  40.47 
 
 
270 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  42.58 
 
 
270 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4493  Creatininase  42.75 
 
 
267 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.930065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0589  creatininase  42.19 
 
 
287 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  41.77 
 
 
265 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  41.92 
 
 
268 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0737  Creatininase  46.09 
 
 
275 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0368  creatininase  44.81 
 
 
282 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4444  creatininase  41.67 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  40.17 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  40.87 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  42.91 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0261  creatininase  41.9 
 
 
270 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  40.87 
 
 
258 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  41.18 
 
 
272 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  41.54 
 
 
272 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  39.67 
 
 
273 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1478  creatininase  40.68 
 
 
261 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  41.8 
 
 
275 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  40.76 
 
 
272 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0569  creatininase  42.8 
 
 
270 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0569  creatininase  40.71 
 
 
271 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  41.02 
 
 
289 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  40.16 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1081  Creatininase  44.02 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2093  Creatininase  43.08 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  42.35 
 
 
267 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1171  creatininase  42.19 
 
 
277 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3383  Creatininase  41.1 
 
 
262 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.81678  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1374  creatininase  41.77 
 
 
260 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  34.73 
 
 
262 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2766  creatininase  38.49 
 
 
263 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  35.27 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2844  creatininase  37.66 
 
 
246 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2461  Creatininase  37.4 
 
 
275 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.751593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  32.3 
 
 
267 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  32.3 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  35.92 
 
 
271 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  32.37 
 
 
267 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1108  creatininase  34.7 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  38 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  39 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0727  creatininase  40.54 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17310  uncharacterized protein, putative amidase  36.86 
 
 
266 aa  131  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00237656  normal  0.0796257 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05871  creatininase  37.16 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05871  creatininase  35.02 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.294847  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  35.29 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1862  creatininase  36.24 
 
 
265 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.168634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0531  creatininase  34.75 
 
 
262 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05951  creatininase  36.32 
 
 
262 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05571  creatininase  35.53 
 
 
264 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05341  creatininase  36.44 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.662589  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  33.93 
 
 
244 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3204  creatininase  39.08 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1831  Creatininase  32.69 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  40.18 
 
 
260 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3038  creatininase  33.99 
 
 
264 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  32.03 
 
 
242 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  32.26 
 
 
245 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  33.59 
 
 
259 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1978  Creatininase  32.8 
 
 
265 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0080  Creatininase  32.16 
 
 
249 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  36.67 
 
 
240 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  28.36 
 
 
243 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  35.09 
 
 
243 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2750  Creatininase  33.2 
 
 
252 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000405281  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  30.47 
 
 
245 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4704  Creatininase  33.77 
 
 
245 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0614  Creatininase  32.39 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8302  Creatininase  33.33 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3084  Creatininase  37.57 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  31.62 
 
 
237 aa  95.5  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  30.8 
 
 
243 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  30.13 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1019  creatininase  33.58 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1799  creatininase  35.96 
 
 
255 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1632  creatininase  31.78 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0487639  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3774  Creatininase  35.62 
 
 
237 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0078  creatininase  34.13 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  38.46 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1638  creatininase  34.44 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5108  Creatininase  38.37 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2360  Creatininase  35.44 
 
 
237 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>