202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1019 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1019  creatininase  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2124  hypothetical protein  73.93 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3275  creatininase  64.45 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6282  creatininase  60.56 
 
 
277 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1160  Creatininase  50.21 
 
 
276 aa  231  6e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3410  hypothetical protein  98.15 
 
 
176 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0459  creatininase  43.68 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0014  amidase-like protein  39.2 
 
 
252 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0751  creatininase  36.55 
 
 
251 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.67672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0738  creatininase, putative  35.96 
 
 
203 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0340652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3192  Creatininase  32.17 
 
 
244 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4770  hypothetical protein  46.3 
 
 
131 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264844  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0161  Creatininase  28.57 
 
 
239 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0997  creatininase  34.54 
 
 
242 aa  102  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0796188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0915  Creatininase  31.42 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00245978 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3053  creatininase  33.58 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0661  creatininase  32.59 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00264542  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2123  creatininase  29.67 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1592  creatinine amidohydrolase  30.45 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.306443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3729  creatininase  33.19 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0114  creatininase  29.58 
 
 
245 aa  89.7  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.863152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0872  creatininase  29.84 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1659  creatininase  28.75 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142851  normal  0.859758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1248  Creatininase  32.08 
 
 
299 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0866  creatininase  29.44 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0883  creatininase  29.44 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693301  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0548  Creatininase  30.89 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.105845  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3867  Creatininase  27.95 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.067278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  32.56 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2975  Creatininase  32.33 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448645  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1412  Creatininase  29.44 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0974833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3905  Creatininase  28.74 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal  0.128884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1784  creatininase  29.76 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2260  creatininase  29.24 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.124432  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7098  creatininase  28.68 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0507  creatininase  34.41 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.061874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1722  creatinine amidohydrolase  29 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.654725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1506  Creatininase  27.03 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000254025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2272  creatininase  30.73 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.434996  hitchhiker  0.000326834 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0945  Creatininase  30.11 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.372006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3038  creatininase  28.81 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1337  creatininase  26.38 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3084  Creatininase  27.87 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1449  Creatininase  29.41 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1847  Creatininase  26.19 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2138  Creatininase  28.57 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  31.2 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1497  creatininase  28 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5280  creatinine amidohydrolase  26.25 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3852  creatininase  32.86 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  31.95 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  31.2 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3788  creatininase  27.76 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288447  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0822  creatininase  31.05 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3261  creatininase  28.16 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00284934  normal  0.180862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0793  Creatininase  26.42 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2487  Creatininase  27.35 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1799  creatininase  26.27 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2928  Creatininase  27.27 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0205  Creatininase  25.98 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  28.25 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2078  Creatininase  28.26 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32638e-16 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0222  creatininase  26.4 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4134  Creatininase  27.8 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1271  hypothetical protein  30.58 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5123  creatininase  26.61 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3125  Creatininase  31.65 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2940  Creatininase  30.86 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4095  Creatininase  26.25 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2410  Creatininase  32.49 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.164045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1376  creatininase  29.41 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199935  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2133  creatininase  32.07 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1602  creatininase  30.12 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  0.080982 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4661  Creatininase  28.46 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02571  hypothetical protein  29.55 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2244  Creatininase  30.61 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3977  Creatininase  26.79 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.682721  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0472  Creatininase  30.64 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4757  Creatininase  31.09 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0217  creatininase  26.64 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.240756  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0910  Creatininase  26.56 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  33.01 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1389  Creatininase  27.27 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.569079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  28.16 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0580  Creatininase  29.69 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4561  creatininase  33.01 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  decreased coverage  0.00113285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3869  creatininase  28.57 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0288  hypothetical protein  27.24 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.742754  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1860  hypothetical protein  31.32 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.21742  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07781  creatininase  30.35 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1636  creatininase  31.63 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.136461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2031  Creatininase  32.4 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4930  Creatininase  31.36 
 
 
240 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0306172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4012  creatininase  25.83 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3103  Creatininase  27.17 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3234  creatininase  29.65 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1161  Creatininase  27.68 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0886457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1712  creatininase  32.64 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.89786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0769  Creatininase  31.58 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6509  creatininase  26.36 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502556  normal  0.191347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>