21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3410 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1019  creatininase  98.15 
 
 		 263 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2124  hypothetical protein  70.59 
 
 		 267 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3275  creatininase  68.04 
 
 		 260 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6282  creatininase  61.22 
 
 		 277 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1160  Creatininase  50.94 
 
 		 276 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4770  hypothetical protein  45.92 
 
 		 131 aa  91.7  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0459  creatininase  45.05 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0014  amidase-like protein  42.05 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0738  creatininase, putative  36.78 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0340652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0751  creatininase  36.78 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.67672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0424  creatininase  40.66 
 
 		 272 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2638  creatininase  36.56 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0883  creatininase  35.92 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0858685  hitchhiker  0.00255114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3681  Creatininase  35.63 
 
 		 262 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0330  creatininase  41.11 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.128511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3729  creatininase  26.55 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3547  creatinine amidohydrolase  27.98 
 
 		 266 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0661  creatininase  37.66 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00264542  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3794  creatinine amidohydrolase  36.78 
 
 		 273 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1102  Creatininase  67.86 
 
 		 272 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>