163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2231 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2231  arsenate reductase and related  100 
 
 
112 aa  229  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.376632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2937  arsenate reductase and related  66.96 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0973954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2309  arsenate reductase and related  58.04 
 
 
111 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1470  arsenate reductase and related  52.21 
 
 
113 aa  128  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.222318  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0726  arsenate reductase and related  55.75 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000014024  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0403  arsenate reductase and related  41.28 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1805  arsenate reductase-like protein  42.61 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  33.93 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  27.93 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  28.97 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  31.82 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3375  arsenate reductase and related  28.93 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956996  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  29.46 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  31.03 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  31.03 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  30.63 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  30.56 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  28.18 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  29.46 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  27.68 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  30.28 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  26.55 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  29.73 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  31.25 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  31.48 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  26.61 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  29.46 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  30.91 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  26.13 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  27.27 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  26.13 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  27.93 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  27.93 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  32.04 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  26.55 
 
 
115 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  26.55 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  31.91 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  28.97 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  24.55 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  31.91 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  26.42 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  29.09 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  31.91 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  26.85 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  29.63 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  27.93 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  29.63 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  24.53 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  24.32 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  24.32 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  24.78 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  25.69 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  25.23 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  25.23 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  25.96 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0744  arsenate reductase  30.36 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000148038  hitchhiker  0.000145224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  25.47 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  26.67 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  24.32 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  30.48 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  24.32 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  26.73 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  30.48 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  25.45 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  30.48 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2040  arsenate reductase-like protein  28.97 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  25 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  26.85 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  26.36 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  25.47 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  25.93 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  25.71 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  24.79 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  25 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  27.62 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0576  transcriptional regulator Spx  30.19 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.926413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  25.44 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0996  transcriptional regulator Spx  31.53 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.444698  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1015  transcriptional regulator Spx  31.53 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000679905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  22.12 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  26.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  25.24 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  26.67 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  25.24 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  25.24 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  25.69 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  25.23 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  24.32 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  25.93 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2107  arsenate reductase and related  27.52 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.843624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  26.67 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>