58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0459 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0459  hmc operon protein 6  100 
 
 		 127 aa  267  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0648  hmc operon protein 6  44.92 
 
 		 462 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0872  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.41 
 
 		 461 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.301742  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2410  hypothetical protein  44.74 
 
 		 461 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.688183  normal  0.0784806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.11 
 
 		 463 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0573  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45 
 
 		 460 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2255  hypothetical protein  40.68 
 
 		 460 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0845  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.19 
 
 		 462 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  39.42 
 
 		 444 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.8 
 
 		 451 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.79 
 
 		 438 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.54 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  30.77 
 
 		 439 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  31.9 
 
 		 439 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  30.77 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.77 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.91 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  32.76 
 
 		 420 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.27 
 
 		 453 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.09 
 
 		 505 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 531 aa  50.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  28.24 
 
 		 515 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 534 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 534 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 472 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  28.46 
 
 		 536 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.56 
 
 		 507 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.3 
 
 		 537 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  27.73 
 
 		 520 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  28.16 
 
 		 542 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0450  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.05 
 
 		 547 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1947  DsrK protein  28.18 
 
 		 549 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  27.68 
 
 		 549 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  27.73 
 
 		 549 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.93 
 
 		 533 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  26.77 
 
 		 500 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  28.18 
 
 		 550 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.28 
 
 		 496 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.37 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  28.18 
 
 		 549 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.91 
 
 		 431 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 471 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.43 
 
 		 437 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  24.79 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  24.22 
 
 		 515 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 471 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.1 
 
 		 534 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  25.98 
 
 		 549 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  31.73 
 
 		 459 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 411 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.55 
 
 		 230 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1958  hypothetical protein  21.71 
 
 		 517 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  25.2 
 
 		 536 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  27.03 
 
 		 549 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.84 
 
 		 431 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  28.03 
 
 		 536 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  25.77 
 
 		 418 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  29.09 
 
 		 1308 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>