22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2514 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2514  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 561 aa  1075    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3386  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.86 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.407746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1490  Tetratricopeptide domain-containing protein  32.91 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.606024  normal  0.0181218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 878 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.46 
 
 		 1694 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 659 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.9 
 
 		 636 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 		 1180 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.24 
 
 		 493 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3457  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.85 
 
 		 810 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.23 
 
 		 836 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1276 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1261 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 684 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 782 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 927 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 740 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 632 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>