68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3613 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3613    100 
 
 		 426 bp  844    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449153  normal  0.593535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5957  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  83.96 
 
 		 1137 bp  75.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  95.12 
 
 		 375 bp  65.9  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  95.12 
 
 		 921 bp  65.9  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  94.87 
 
 		 330 bp  61.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  92.86 
 
 		 501 bp  60  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  92.86 
 
 		 372 bp  60  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  97.06 
 
 		 369 bp  60  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  92.86 
 
 		 420 bp  60  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  92.68 
 
 		 327 bp  58  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  86.15 
 
 		 1083 bp  58  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  94.59 
 
 		 420 bp  58  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  92.68 
 
 		 843 bp  58  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0110    92.31 
 
 		 153 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  92.31 
 
 		 849 bp  54  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0361    92.31 
 
 		 848 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  92.31 
 
 		 849 bp  54  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2497  thioredoxin  92.31 
 
 		 210 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  92.31 
 
 		 906 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  92.31 
 
 		 849 bp  54  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  92.31 
 
 		 2757 bp  54  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  92.31 
 
 		 339 bp  54  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  94.12 
 
 		 324 bp  52  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  92.11 
 
 		 372 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  94.12 
 
 		 375 bp  52  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  94.12 
 
 		 381 bp  52  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  94.12 
 
 		 378 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  94.12 
 
 		 378 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  96.55 
 
 		 561 bp  50.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  96.55 
 
 		 561 bp  50.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  93.94 
 
 		 366 bp  50.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  96.55 
 
 		 609 bp  50.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  96.55 
 
 		 549 bp  50.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  96.55 
 
 		 549 bp  50.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  90.24 
 
 		 846 bp  50.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  96.55 
 
 		 561 bp  50.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  96.55 
 
 		 552 bp  50.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  90.24 
 
 		 480 bp  50.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  96.55 
 
 		 561 bp  50.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  96.55 
 
 		 561 bp  50.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  96.55 
 
 		 561 bp  50.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  93.75 
 
 		 576 bp  48.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0367  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  93.75 
 
 		 576 bp  48.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  93.75 
 
 		 381 bp  48.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  91.43 
 
 		 849 bp  46.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  89.74 
 
 		 438 bp  46.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  91.43 
 
 		 333 bp  46.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  93.55 
 
 		 378 bp  46.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  91.43 
 
 		 849 bp  46.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  89.74 
 
 		 849 bp  46.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  91.43 
 
 		 849 bp  46.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  96.3 
 
 		 555 bp  46.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  91.43 
 
 		 849 bp  46.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  91.43 
 
 		 849 bp  46.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  96.3 
 
 		 549 bp  46.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  91.43 
 
 		 909 bp  46.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  91.43 
 
 		 894 bp  46.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  89.74 
 
 		 327 bp  46.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  91.43 
 
 		 849 bp  46.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  91.43 
 
 		 525 bp  46.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>