162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0361 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0361    100 
 
 		 848 bp  1681    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00175282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  99.41 
 
 		 2757 bp  1635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  94.23 
 
 		 849 bp  1287    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  99.88 
 
 		 906 bp  1667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  99.86 
 
 		 690 bp  1352    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  99.41 
 
 		 849 bp  1635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  99.41 
 
 		 849 bp  1635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0109    99.86 
 
 		 690 bp  1352    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  85.63 
 
 		 849 bp  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  83.98 
 
 		 849 bp  597  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  83.98 
 
 		 849 bp  597  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  83.75 
 
 		 849 bp  581  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  83.51 
 
 		 849 bp  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  83.39 
 
 		 849 bp  557  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  83.39 
 
 		 849 bp  557  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2497  thioredoxin  100 
 
 		 210 bp  301  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0110    100 
 
 		 153 bp  301  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  83.7 
 
 		 849 bp  220  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  86.58 
 
 		 849 bp  196  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  85.28 
 
 		 849 bp  172  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  91.43 
 
 		 945 bp  91.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  100 
 
 		 843 bp  85.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  89.33 
 
 		 939 bp  85.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  79.18 
 
 		 843 bp  81.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  94.34 
 
 		 957 bp  81.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  89.71 
 
 		 909 bp  79.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  89.71 
 
 		 909 bp  79.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  85.26 
 
 		 846 bp  77.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  90.32 
 
 		 909 bp  75.8  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  97.62 
 
 		 438 bp  75.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  95.56 
 
 		 909 bp  73.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  92.31 
 
 		 1221 bp  71.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  97.5 
 
 		 375 bp  71.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  95.45 
 
 		 954 bp  71.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  97.44 
 
 		 846 bp  69.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  95.35 
 
 		 330 bp  69.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  97.44 
 
 		 921 bp  69.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  97.44 
 
 		 480 bp  69.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  97.44 
 
 		 327 bp  69.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  95.24 
 
 		 843 bp  67.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  95.24 
 
 		 453 bp  67.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  93.48 
 
 		 327 bp  67.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  95.24 
 
 		 453 bp  67.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  89.47 
 
 		 912 bp  65.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  90.57 
 
 		 819 bp  65.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  100 
 
 		 324 bp  65.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  93.33 
 
 		 909 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  81.9 
 
 		 933 bp  63.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  100 
 
 		 378 bp  63.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  93.18 
 
 		 981 bp  63.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  97.22 
 
 		 369 bp  63.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  97.22 
 
 		 909 bp  63.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  97.22 
 
 		 909 bp  63.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  97.14 
 
 		 438 bp  61.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  94.87 
 
 		 438 bp  61.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  89.09 
 
 		 1026 bp  61.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  94.87 
 
 		 933 bp  61.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  94.87 
 
 		 375 bp  61.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  91.49 
 
 		 444 bp  61.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  94.87 
 
 		 375 bp  61.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  94.87 
 
 		 915 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  92.86 
 
 		 327 bp  60  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  92.86 
 
 		 441 bp  60  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  94.74 
 
 		 441 bp  60  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  89.8 
 
 		 858 bp  58  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  92.68 
 
 		 975 bp  58  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  86.15 
 
 		 861 bp  58  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  96.97 
 
 		 336 bp  58  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  92.68 
 
 		 912 bp  58  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  92.5 
 
 		 366 bp  56  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  96.88 
 
 		 438 bp  56  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  96.88 
 
 		 774 bp  56  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  81.48 
 
 		 909 bp  56  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  89.58 
 
 		 333 bp  56  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  94.44 
 
 		 1182 bp  56  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.370556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  94.29 
 
 		 561 bp  54  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  94.29 
 
 		 450 bp  54  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  94.29 
 
 		 609 bp  54  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  94.29 
 
 		 333 bp  54  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  92.31 
 
 		 333 bp  54  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  94.29 
 
 		 921 bp  54  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  94.29 
 
 		 936 bp  54  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  92.31 
 
 		 921 bp  54  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1831  thioredoxin  90.7 
 
 		 351 bp  54  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  96.77 
 
 		 312 bp  54  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  90.7 
 
 		 393 bp  54  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  96.77 
 
 		 453 bp  54  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  94.29 
 
 		 378 bp  54  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  92.31 
 
 		 363 bp  54  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  94.29 
 
 		 378 bp  54  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  96.77 
 
 		 438 bp  54  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  94.29 
 
 		 561 bp  54  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  92.31 
 
 		 975 bp  54  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  94.29 
 
 		 561 bp  54  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  92.31 
 
 		 426 bp  54  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  94.29 
 
 		 561 bp  54  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  94.29 
 
 		 561 bp  54  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  92.31 
 
 		 375 bp  54  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3613    92.31 
 
 		 426 bp  54  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449153  normal  0.593535 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  94.29 
 
 		 561 bp  54  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>