32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2939 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  59.63 
 
 
323 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  59.37 
 
 
319 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  51.56 
 
 
329 aa  291  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  44.05 
 
 
316 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  39.29 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  36.25 
 
 
362 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  33.98 
 
 
457 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  30.54 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  31.79 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  32 
 
 
319 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  26.32 
 
 
397 aa  90.1  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  22.82 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  68.18 
 
 
81 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  23.84 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  91.11 
 
 
62 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  77.78 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  31.17 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  24.08 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  22.11 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  23.05 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  22.56 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  23.05 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  21.86 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  23.02 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  21.51 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0370  nucleoside recognition domain-containing protein  29.87 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.270899  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  27.5 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  24.1 
 
 
327 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  26.79 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  24.23 
 
 
302 aa  52.8  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  22.84 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>