25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0477 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  790    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  31.13 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  30.79 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  27.41 
 
 		 319 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  28.93 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  28.29 
 
 		 318 aa  92.8  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  27.03 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  26.32 
 
 		 319 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  32.96 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  26.07 
 
 		 319 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  28.31 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  24.35 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  23.91 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  27.36 
 
 		 312 aa  69.7  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  25.31 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  24.91 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23.4 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  25.09 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  26.92 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  26.89 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  18.06 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  18.06 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  21.43 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  18.75 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  18.71 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>