24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1669 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
327 aa  626  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  56.52 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  26.71 
 
 
331 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  27.36 
 
 
314 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  24.75 
 
 
317 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  24.75 
 
 
317 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  26.8 
 
 
314 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  24.75 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  22.18 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  26.86 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  28.57 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  29.65 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  22.56 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23.29 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  23.75 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  25.31 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  30 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  24.84 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  29.91 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  24.1 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  28.15 
 
 
323 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  23.81 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  25.44 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  27.3 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>