26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1099 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
314 aa  614  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  89.81 
 
 
314 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  89.67 
 
 
331 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  67.41 
 
 
317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  46.82 
 
 
323 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  44.59 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  44.59 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  28.34 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  24.62 
 
 
349 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  24.2 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  24.33 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  22.88 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  25.56 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  22.61 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  23.72 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  24.27 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  22.56 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  24.63 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  23.19 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  24.04 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  21.98 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  23.02 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  23 
 
 
378 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  23.91 
 
 
316 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0110  hypothetical protein  22.66 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  19.27 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>