33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2421 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  49.52 
 
 
323 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  44.05 
 
 
319 aa  299  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  45.89 
 
 
319 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  46.69 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  41.37 
 
 
378 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  35.21 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  29.93 
 
 
319 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  28.62 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  29.51 
 
 
318 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  27.53 
 
 
310 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  27.8 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  27.8 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  22.66 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  24.29 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  24.71 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  22.65 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  25 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  23.05 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  24.44 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  24.33 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  24.14 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  28.74 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  54.17 
 
 
81 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0370  nucleoside recognition domain-containing protein  29.49 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.270899  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  22.57 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  52.27 
 
 
62 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  57.14 
 
 
90 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  25.39 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  24.71 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  25.48 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  20.49 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>