28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0234 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
298 aa  566  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0370  nucleoside recognition domain-containing protein  96.31 
 
 
298 aa  421  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.270899  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  29.69 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  28.85 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  29.47 
 
 
319 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  31.46 
 
 
319 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  27.09 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  26.57 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  28.52 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  28.71 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  19.26 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  30.08 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  31.18 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  27.44 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  29.18 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  19.93 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  20.29 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  21.35 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  21.35 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  19 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  33.58 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  27.24 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  18.68 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  33.21 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  27.24 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  28.85 
 
 
362 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  26.27 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  41.82 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>