23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2642 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  868    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  52.81 
 
 
378 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  54.02 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  38.95 
 
 
323 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  37.01 
 
 
316 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  34.38 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  36.52 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  35.84 
 
 
329 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  31.64 
 
 
397 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  26.56 
 
 
318 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  25.15 
 
 
310 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  26.83 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  21.52 
 
 
314 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  25 
 
 
312 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  19.61 
 
 
308 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  51.16 
 
 
81 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  21.88 
 
 
317 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  26.33 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  32.98 
 
 
312 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  26.73 
 
 
302 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  41.82 
 
 
298 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  44.44 
 
 
62 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>