28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2309 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  698    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  56.35 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  54.81 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  36.25 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  40.91 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  40.91 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  39.74 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  38.81 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  32.63 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  28.78 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  27.74 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  26.69 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  27.6 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  26.39 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  25.75 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  22.35 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  22.68 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  23.13 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  19.75 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  27.01 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  22.53 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  55.81 
 
 		 81 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  27.21 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  57.89 
 
 		 62 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  27.6 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  28.2 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  27.43 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>