171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0308 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.94 
 
 
680 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.73 
 
 
680 aa  734    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.43 
 
 
694 aa  719    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.23 
 
 
688 aa  751    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.33 
 
 
671 aa  722    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.21 
 
 
679 aa  766    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.69 
 
 
706 aa  694    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.77 
 
 
705 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.22 
 
 
706 aa  673    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.62 
 
 
680 aa  726    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.58 
 
 
684 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.8 
 
 
677 aa  766    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.63 
 
 
702 aa  707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.75 
 
 
682 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  58.44 
 
 
690 aa  746    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.65 
 
 
707 aa  681    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.55 
 
 
717 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.66 
 
 
689 aa  718    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.29 
 
 
707 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.19 
 
 
732 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.55 
 
 
672 aa  737    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.3 
 
 
706 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.14 
 
 
706 aa  701    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.89 
 
 
710 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.99 
 
 
704 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.73 
 
 
712 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.08 
 
 
697 aa  692    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.12 
 
 
681 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.12 
 
 
681 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.49 
 
 
681 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.44 
 
 
684 aa  756    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2668  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.64 
 
 
693 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0348916  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.92 
 
 
746 aa  760    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.66 
 
 
694 aa  743    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.52 
 
 
692 aa  712    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.18 
 
 
823 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.65 
 
 
712 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.99 
 
 
687 aa  716    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.79 
 
 
712 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.01 
 
 
715 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.98 
 
 
686 aa  745    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  55.84 
 
 
683 aa  678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.44 
 
 
681 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.61 
 
 
706 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.6 
 
 
700 aa  701    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.6 
 
 
710 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.88 
 
 
675 aa  711    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.57 
 
 
711 aa  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.58 
 
 
712 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.52 
 
 
694 aa  739    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.19 
 
 
704 aa  710    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2820  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.31 
 
 
690 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000206643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50 
 
 
671 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.33 
 
 
711 aa  669    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.6 
 
 
710 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.36 
 
 
712 aa  656    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 
682 aa  1345    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.96 
 
 
842 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3976  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.11 
 
 
714 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.687773  decreased coverage  0.00231033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.26 
 
 
715 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.29 
 
 
712 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.62 
 
 
712 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.17 
 
 
700 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.84 
 
 
718 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.56 
 
 
718 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.29 
 
 
669 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.56 
 
 
775 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.21 
 
 
711 aa  621  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  51.79 
 
 
654 aa  619  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4197  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54 
 
 
713 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.488103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.78 
 
 
653 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.57 
 
 
672 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.9 
 
 
744 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  48.69 
 
 
679 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.1 
 
 
652 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.54 
 
 
679 aa  590  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  47.53 
 
 
693 aa  588  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.28 
 
 
674 aa  588  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.65 
 
 
694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.94 
 
 
692 aa  581  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.41 
 
 
672 aa  579  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.61 
 
 
792 aa  582  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0710  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.4 
 
 
679 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.53 
 
 
779 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.26 
 
 
779 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.72 
 
 
704 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.56 
 
 
694 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.22 
 
 
706 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  48.05 
 
 
687 aa  571  1e-161  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.44 
 
 
718 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2481  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.32 
 
 
775 aa  568  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.618403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.97 
 
 
683 aa  566  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0230915  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.01 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0766  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.9 
 
 
708 aa  559  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0013002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.02 
 
 
741 aa  559  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0692  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.17 
 
 
708 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000200015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_672  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.17 
 
 
708 aa  558  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0223  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  49.19 
 
 
778 aa  557  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0496  Inorganic diphosphatase  48.39 
 
 
777 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.79 
 
 
890 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>