171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3408 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.13 
 
 
680 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.8 
 
 
675 aa  747    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.34 
 
 
694 aa  757    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.88 
 
 
718 aa  931    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.17 
 
 
688 aa  801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.62 
 
 
671 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.78 
 
 
679 aa  764    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  77.17 
 
 
706 aa  1048    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  57.02 
 
 
690 aa  754    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.08 
 
 
706 aa  998    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60 
 
 
684 aa  759    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.34 
 
 
677 aa  776    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.86 
 
 
702 aa  946    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  77.45 
 
 
707 aa  1029    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  69.04 
 
 
717 aa  868    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.38 
 
 
689 aa  778    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  77.59 
 
 
707 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.5 
 
 
732 aa  769    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.61 
 
 
672 aa  659    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  75.94 
 
 
706 aa  1003    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.47 
 
 
706 aa  1040    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.6 
 
 
687 aa  743    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.43 
 
 
704 aa  820    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.5 
 
 
712 aa  968    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.02 
 
 
697 aa  938    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.81 
 
 
681 aa  739    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.81 
 
 
681 aa  739    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.92 
 
 
681 aa  756    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.31 
 
 
684 aa  772    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.26 
 
 
680 aa  731    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2668  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.39 
 
 
693 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0348916  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.6 
 
 
746 aa  800    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.8 
 
 
694 aa  803    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.47 
 
 
692 aa  756    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.32 
 
 
823 aa  753    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.03 
 
 
680 aa  756    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.08 
 
 
712 aa  984    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.06 
 
 
842 aa  789    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.96 
 
 
686 aa  789    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.04 
 
 
681 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.61 
 
 
706 aa  1002    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.74 
 
 
775 aa  926    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  69.67 
 
 
700 aa  922    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 
710 aa  1377    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  59.49 
 
 
683 aa  728    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.93 
 
 
711 aa  989    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.95 
 
 
718 aa  934    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.52 
 
 
694 aa  797    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  75.56 
 
 
704 aa  1009    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4197  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  75.56 
 
 
713 aa  878    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.488103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2820  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.2 
 
 
690 aa  711    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000206643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.5 
 
 
712 aa  989    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  86.99 
 
 
715 aa  1190    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.55 
 
 
711 aa  980    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 
710 aa  1377    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.73 
 
 
712 aa  897    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.27 
 
 
682 aa  674    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.96 
 
 
712 aa  978    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3976  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  92.72 
 
 
714 aa  1200    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.687773  decreased coverage  0.00231033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  88.67 
 
 
715 aa  1197    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.95 
 
 
712 aa  743    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  97.42 
 
 
710 aa  1290    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.4 
 
 
712 aa  937    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.22 
 
 
671 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.22 
 
 
705 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.25 
 
 
669 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.43 
 
 
682 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.41 
 
 
700 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.13 
 
 
693 aa  554  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.13 
 
 
711 aa  552  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.11 
 
 
672 aa  545  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.55 
 
 
704 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.05 
 
 
653 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.29 
 
 
672 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.68 
 
 
674 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.37 
 
 
687 aa  535  1e-151  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0496  Inorganic diphosphatase  45.86 
 
 
777 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.71 
 
 
679 aa  535  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0223  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.11 
 
 
778 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0766  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.34 
 
 
708 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0013002  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.13 
 
 
679 aa  531  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.62 
 
 
652 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0710  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.38 
 
 
679 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.22 
 
 
744 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.23 
 
 
694 aa  526  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.01 
 
 
792 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0692  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.61 
 
 
708 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000200015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_672  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.47 
 
 
708 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2413  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.15 
 
 
698 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.435461  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.82 
 
 
654 aa  525  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.12 
 
 
706 aa  525  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.9 
 
 
741 aa  520  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.03 
 
 
890 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.41 
 
 
694 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.02 
 
 
683 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0230915  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4304  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.96 
 
 
779 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.07 
 
 
694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.59 
 
 
692 aa  515  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.9 
 
 
779 aa  515  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.62 
 
 
779 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>