171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2668 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.47 
 
 
680 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.13 
 
 
675 aa  844    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  69.91 
 
 
694 aa  860    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.18 
 
 
718 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.75 
 
 
688 aa  914    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.26 
 
 
842 aa  1034    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.52 
 
 
671 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.54 
 
 
680 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.16 
 
 
679 aa  885    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.34 
 
 
706 aa  772    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.07 
 
 
715 aa  745    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.94 
 
 
706 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.57 
 
 
684 aa  813    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.11 
 
 
677 aa  905    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.76 
 
 
702 aa  775    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.26 
 
 
710 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  58.81 
 
 
690 aa  742    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.71 
 
 
707 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.63 
 
 
717 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  79.51 
 
 
689 aa  1031    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.43 
 
 
707 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.46 
 
 
732 aa  1024    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.81 
 
 
672 aa  697    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.6 
 
 
706 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.49 
 
 
706 aa  780    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.46 
 
 
704 aa  710    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.53 
 
 
712 aa  701    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.74 
 
 
697 aa  761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.71 
 
 
681 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.71 
 
 
681 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  68.63 
 
 
681 aa  877    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.62 
 
 
684 aa  850    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.23 
 
 
712 aa  708    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2668  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 
693 aa  1346    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0348916  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.19 
 
 
746 aa  1086    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.58 
 
 
694 aa  1073    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.31 
 
 
692 aa  1043    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  77.79 
 
 
823 aa  959    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.09 
 
 
711 aa  720    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.72 
 
 
694 aa  1077    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.6 
 
 
712 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.17 
 
 
712 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.47 
 
 
686 aa  988    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.92 
 
 
681 aa  804    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.94 
 
 
706 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.32 
 
 
775 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.95 
 
 
700 aa  761    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.87 
 
 
680 aa  801    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.54 
 
 
711 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.61 
 
 
718 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.21 
 
 
687 aa  809    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.46 
 
 
704 aa  764    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4197  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.58 
 
 
713 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.488103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2820  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.09 
 
 
690 aa  725    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000206643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.4 
 
 
710 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.06 
 
 
712 aa  679    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.57 
 
 
682 aa  700    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.4 
 
 
710 aa  754    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3976  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.57 
 
 
714 aa  717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.687773  decreased coverage  0.00231033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.78 
 
 
715 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.59 
 
 
712 aa  957    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  66.91 
 
 
683 aa  806    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.47 
 
 
712 aa  691    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.07 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  51.32 
 
 
654 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.22 
 
 
669 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.51 
 
 
674 aa  593  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  49.07 
 
 
693 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.62 
 
 
672 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.55 
 
 
711 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.23 
 
 
672 aa  582  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.16 
 
 
705 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.68 
 
 
779 aa  569  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.21 
 
 
706 aa  567  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  47.71 
 
 
687 aa  567  1e-160  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49 
 
 
682 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.14 
 
 
779 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.63 
 
 
700 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.99 
 
 
718 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.82 
 
 
653 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.19 
 
 
694 aa  553  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.13 
 
 
694 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2481  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.06 
 
 
775 aa  549  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.618403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.65 
 
 
744 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.71 
 
 
692 aa  547  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.32 
 
 
741 aa  546  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.26 
 
 
652 aa  545  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.84 
 
 
679 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.26 
 
 
694 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.7 
 
 
679 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.5 
 
 
692 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2413  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  48.65 
 
 
698 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.435461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  47.06 
 
 
890 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0710  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.27 
 
 
679 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.4 
 
 
674 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.21 
 
 
704 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.62 
 
 
792 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1428  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.56 
 
 
663 aa  525  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31307  H+-PPase family transporter: proton  44.31 
 
 
822 aa  522  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000955532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.42 
 
 
847 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>