171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1472 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.27 
 
 		 680 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.35 
 
 		 694 aa  875    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.64 
 
 		 718 aa  705    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.89 
 
 		 688 aa  972    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.45 
 
 		 671 aa  693    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.54 
 
 		 679 aa  913    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.92 
 
 		 706 aa  791    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60 
 
 		 715 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.93 
 
 		 680 aa  806    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.42 
 
 		 684 aa  824    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.72 
 
 		 677 aa  923    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.57 
 
 		 702 aa  783    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.43 
 
 		 707 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.34 
 
 		 717 aa  748    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 		 689 aa  1355    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.18 
 
 		 707 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  89.7 
 
 		 732 aa  1166    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.15 
 
 		 672 aa  731    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.07 
 
 		 706 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.12 
 
 		 706 aa  793    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  86.5 
 
 		 842 aa  1149    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.86 
 
 		 704 aa  757    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.14 
 
 		 712 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.85 
 
 		 710 aa  755    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.05 
 
 		 697 aa  786    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.35 
 
 		 681 aa  800    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.35 
 
 		 681 aa  800    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.86 
 
 		 681 aa  917    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.16 
 
 		 684 aa  863    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.37 
 
 		 706 aa  769    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2668  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  79.51 
 
 		 693 aa  1010    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0348916  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  89.71 
 
 		 746 aa  1208    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  85.21 
 
 		 694 aa  1148    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  85.22 
 
 		 692 aa  1103    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.99 
 
 		 823 aa  1046    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.28 
 
 		 675 aa  870    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.19 
 
 		 671 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.68 
 
 		 686 aa  1069    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.37 
 
 		 687 aa  808    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.27 
 
 		 681 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.23 
 
 		 706 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.64 
 
 		 775 aa  702    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.88 
 
 		 700 aa  799    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.77 
 
 		 710 aa  779    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.34 
 
 		 711 aa  751    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  85.36 
 
 		 694 aa  1151    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.4 
 
 		 718 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  67.93 
 
 		 683 aa  837    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  59.77 
 
 		 690 aa  766    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.23 
 
 		 712 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.56 
 
 		 704 aa  801    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4197  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.22 
 
 		 713 aa  683    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.488103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2820  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.16 
 
 		 690 aa  773    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000206643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.32 
 
 		 712 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  66.87 
 
 		 680 aa  816    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.72 
 
 		 711 aa  754    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.77 
 
 		 710 aa  779    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.05 
 
 		 669 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.74 
 
 		 712 aa  719    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.52 
 
 		 682 aa  717    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.29 
 
 		 712 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3976  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.31 
 
 		 714 aa  734    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.687773  decreased coverage  0.00231033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.38 
 
 		 715 aa  772    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.46 
 
 		 712 aa  1031    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.06 
 
 		 712 aa  729    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.93 
 
 		 711 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  52.31 
 
 		 672 aa  618  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  52.46 
 
 		 654 aa  618  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.51 
 
 		 682 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  49.28 
 
 		 693 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.38 
 
 		 705 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.07 
 
 		 674 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.91 
 
 		 672 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.17 
 
 		 694 aa  597  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  49.71 
 
 		 687 aa  597  1e-169  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.59 
 
 		 653 aa  595  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.88 
 
 		 779 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.02 
 
 		 706 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.5 
 
 		 700 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.74 
 
 		 779 aa  589  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.74 
 
 		 694 aa  589  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2481  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.59 
 
 		 775 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.618403 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.89 
 
 		 741 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.71 
 
 		 718 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.64 
 
 		 692 aa  581  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.72 
 
 		 694 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.1 
 
 		 744 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  47.59 
 
 		 890 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  50.44 
 
 		 652 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.51 
 
 		 692 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2413  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  50.5 
 
 		 698 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.435461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.29 
 
 		 674 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.15 
 
 		 704 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1428  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.93 
 
 		 663 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.29 
 
 		 792 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.25 
 
 		 847 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0710  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.9 
 
 		 679 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.83 
 
 		 679 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.69 
 
 		 679 aa  547  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6198  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.86 
 
 		 753 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.771465  normal  0.139813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>