155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3101 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3101  carbamate kinase  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000494592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  52.13 
 
 		 310 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  52.13 
 
 		 310 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  52.13 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  52.13 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  52.13 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  52.13 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  51.64 
 
 		 309 aa  310  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  51.8 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  51.8 
 
 		 310 aa  309  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  48.53 
 
 		 313 aa  292  4e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  48.87 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  49.35 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  47.21 
 
 		 310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  48.2 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  46.73 
 
 		 313 aa  272  6e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  45.48 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  46.08 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  46.23 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  44.52 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  45.57 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  45.54 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  44.12 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  42.62 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  44.48 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  42.95 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  45.98 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  42.62 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  43 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  44.12 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  43.53 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  44.62 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  42.81 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  42.81 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  42.81 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  43.13 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  42.17 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  41.27 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  39.41 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  39.41 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  41.67 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  42.3 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  39.87 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  39.68 
 
 		 321 aa  218  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  40.06 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  37.93 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  40.19 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  37.93 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  40.19 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  37.62 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  41.64 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  40.45 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  38.39 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  38.78 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  39.18 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  39.74 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  37.18 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  35.26 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  41.45 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  37.22 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  37.7 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  41.21 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  37.58 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  35.78 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  38.92 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  36.94 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  37.26 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  37.66 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  37.5 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  37.26 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  37.26 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  37.5 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  36.01 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  38.14 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf130  carbamate kinase  38.24 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  38.46 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  37.42 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  37.3 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  39.06 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  37.86 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  34.82 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  36.69 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  38.72 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  38.38 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  34.52 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2214  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.59 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.350348  normal  0.825943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  38.38 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  36.33 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  36.83 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0182  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.96 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  36.89 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  36.49 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  34.07 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  36.51 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  37.3 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  36.51 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  35.87 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  35.87 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  36.13 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  37.1 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>